Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClmpQ8R373 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmpQ8R373 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms