Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2f4Q8R0K9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2f4Q8R0K9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms