Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nsl1Q8K305 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms