Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brd3Q8K2F0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Brd3Q8K2F0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms