Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NgefQ8CHT1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NgefQ8CHT1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NgefQ8CHT1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms