Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Upp2Q8CGR7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Upp2Q8CGR7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms