Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm9955Q8CEJ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm9955Q8CEJ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm9955Q8CEJ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm9955Q8CEJ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9955Q8CEJ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm9955Q8CEJ8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm9955Q8CEJ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm9955Q8CEJ8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm9955Q8CEJ8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm9955Q8CEJ8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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