Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup88Q8CEC0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup88Q8CEC0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup88Q8CEC0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms