Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc63Q8CDV6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc63Q8CDV6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 437.6 ms