Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc73Q8CDM4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms