Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc87Q8CDL9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc87Q8CDL9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms