Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrebrfQ8CDG5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CrebrfQ8CDG5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms