Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bcas3Q8CCN5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcas3Q8CCN5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcas3Q8CCN5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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