Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4aQ8C9S8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4aQ8C9S8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4aQ8C9S8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
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