Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7M3

Trim9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim9Q8C7M3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim9Q8C7M3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim9Q8C7M3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim9Q8C7M3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms