Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc90bQ8C3X2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms