Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx22Q8C084 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx22Q8C084 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms