Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Iffo1Q8BXL9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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