Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx1bQ8BX32 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx1bQ8BX32 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms