Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smad3Q8BUN5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad3Q8BUN5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms