Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcgF3Q8BTQ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PcgF3Q8BTQ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms