Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep55Q8BT07 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms