Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rps6kb1Q8BSK8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rps6kb1Q8BSK8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6kb1Q8BSK8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms