Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSI6

R3hcc1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hcc1Q8BSI6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3hcc1Q8BSI6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3hcc1Q8BSI6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3hcc1Q8BSI6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3hcc1Q8BSI6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
R3hcc1Q8BSI6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3hcc1Q8BSI6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms