Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gga3Q8BMI3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga3Q8BMI3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms