Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fbxo38Q8BMI0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo38Q8BMI0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms