Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Me3Q8BMF3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Me3Q8BMF3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms