Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gabra5Q8BHJ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms