Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe23Q8BGW3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms