Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim6Q8BGE7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms