Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdspl2Q8BG15 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ctdspl2Q8BG15 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctdspl2Q8BG15 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms