Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pld4Q8BG07 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms