Protein–RNA interactions for Protein: Q810U4

Nrcam, Neuronal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrcamQ810U4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NrcamQ810U4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NrcamQ810U4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrcamQ810U4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms