Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChfrQ810L3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChfrQ810L3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms