Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crb2Q80YA8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crb2Q80YA8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crb2Q80YA8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms