Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxna4Q80UG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxna4Q80UG2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plxna4Q80UG2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms