Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
NischQ80TM9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC45.56■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
NischQ80TM9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC45.48■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC45.45■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
NischQ80TM9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC45.41■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC45.38■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.86
NischQ80TM9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC45.37■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.36■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.35■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
NischQ80TM9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms