Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctdp1Q7TSG2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdp1Q7TSG2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdp1Q7TSG2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms