Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1bQ7TSF1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1bQ7TSF1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg1bQ7TSF1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms