Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpf1Q7TND5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpf1Q7TND5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpf1Q7TND5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms