Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcg2Q7TMS5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcg2Q7TMS5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcg2Q7TMS5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms