Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyfip1Q7TMB8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyfip1Q7TMB8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyfip1Q7TMB8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms