Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eci3Q78JN3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eci3Q78JN3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms