Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
March6Q6ZQ89 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
March6Q6ZQ89 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
March6Q6ZQ89 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
March6Q6ZQ89 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
March6Q6ZQ89 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
March6Q6ZQ89 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
March6Q6ZQ89 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
March6Q6ZQ89 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms