Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NinlQ6ZQ12 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NinlQ6ZQ12 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NinlQ6ZQ12 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NinlQ6ZQ12 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NinlQ6ZQ12 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NinlQ6ZQ12 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NinlQ6ZQ12 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NinlQ6ZQ12 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NinlQ6ZQ12 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NinlQ6ZQ12 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NinlQ6ZQ12 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NinlQ6ZQ12 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
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