Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chsy1Q6ZQ11 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy1Q6ZQ11 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms