Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nudcd1Q6PIP5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms