Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx13Q6PHS6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx13Q6PHS6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms