Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm2lQ6PDS0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm2lQ6PDS0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.4 ms