Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I6

Cox11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox11Q6P8I6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox11Q6P8I6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox11Q6P8I6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox11Q6P8I6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms